后篇：蓝之圆盘
通过交换留学前往盛行宝可梦对战的“蓝莓学园”
在“后篇：蓝之圆盘”当中，主人公将会通过交换留学前往学院的姊妹校——“蓝莓学园”。与历史悠久的学院不同，蓝莓学园是近年新成立的学校，特别致力于宝可梦对战的教育。而令人惊讶的是，学校有一大半都位于海中。主人公能够参加课程，与当地的学生们交流，体验别具一格的学校生活。
还原出多种自然环境的海中庭园——
“生态巨蛋”
在“后篇：蓝之圆盘”中，留学时前往的蓝莓学园校内有一座名为“生态巨蛋”的设施，在此通过人工打造的环境十分适宜宝可梦生活。生态巨蛋这个享誉世界的海中庭园，是为了让培育强大训练家的环境得到进一步强化而建造的。
生态巨蛋中有4个区域。每个区域都有各自不同的地理特征与气候，形成了多姿多彩的自然环境。生态巨蛋的墙壁和顶部所映出的人造天空，会根据时段和天气展现出多种姿态。因为各个区域的气温都受到严格的控制，所以只要区域不同，在那里栖息的宝可梦也截然不同。
