山梨博士
研究寶可夢的「進化」，以該領域的權威身分極具盛名的博士。他將寶可夢託付給主角，並委託他完成寶可夢圖鑑。
小光／明輝
山梨博士的助手。在主角踏上完成寶可夢圖鑑的旅程後，在神奧地區的各處提供冒險上的協助，是很可靠的存在。
※依在開始遊戲時選擇的主角外觀而定，山梨博士的助手將是小光或明輝其中一人。
小光
明輝
研究寶可夢的「進化」，以該領域的權威身分極具盛名的博士。他將寶可夢託付給主角，並委託他完成寶可夢圖鑑。
山梨博士的助手。在主角踏上完成寶可夢圖鑑的旅程後，在神奧地區的各處提供冒險上的協助，是很可靠的存在。
※依在開始遊戲時選擇的主角外觀而定，山梨博士的助手將是小光或明輝其中一人。
