ストーリーをクリアしても、まだまだ終わりではないんだ!! 新たに出現する難関ダンジョンや、強力なポケモンたち、素敵な宝物を求めて、冒険は続いていくよ！クリア後に冒険ができる難関ダンジョンでは、伝説のポケモンたちに会えることがあるぞ。ここでは彼らに出会うための方法を少しだけご紹介。また、各タイトルでそれぞれ異なるポケモンたちが登場するので要チェック！
ファイヤー・フリーザー・サンダーはダンジョンの最深層で、勇気ある冒険団を待ち受けているのだ。出会うためには、超難関ダンジョンを最後まで攻略し、倒さなくてはならないぞ！
このポケモンたちに出会うためには、冒険団ランクを一定以上上げた後、冒険の途中で手に入る、「なぞのパーツ」や「ひみつのせきばん」を持っている必要がある。このポケモン達は戦って倒しても必ず仲間になるわけではないので、仲間になるまで何度も挑戦しよう！
エンディング後に隠されている更なる秘密を大公開！ なんとエンディング後、村の中に伝説のポケモン、ライコウ、エンテイ、スイクンが出現するのだ。彼らに話しかけることで冒険団の仲間にすることができるぞ!!
