古くからレンジャーの腕試しの場所となっている遺跡には、「4つの試練をクリアすると災いが起こる」という言い伝えがあった！「みずのしれん」「かぜのしれん」「はかいのしれん」、そして4つめの試練とはいったい……！？
ミッション<2>：ミッションの名場面を大公開！
ポケモンと協力して自然を守ったり、人助けをしたりするポケモンレンジャー。一人前のレンジャーになるためには、ポケモンたちと協力しながら、与えられるミッションをこなしていかなければならない！序盤から終盤までの名場面を紹介しよう！
ミッション1「きょうじゅをごえいせよ！」
序盤<2>～ミッション2「フォルシティじけんぼ」
中盤<1>～「まいごのろうじん」を救え！
ライラの森の奥深くで、ウツドンに押し回されて迷子になってしまったおじいさんを救出するミッション与えられるぞ！ようやく探し出したおじいさんは、ブツブツと文句ばかり言っているのだが……。
せっかく助けてあげたのに、態度は尊大で、怪しい発言も……。
中盤<2>～ジャングルの遺跡に伝わる3つの試練！！
キングドラ、フライゴン、ボーマンダが待っているぞ！
中盤<3>～ジャングルの遺跡を守れ！
道路の奥では、ゴーゴー団が新開発のスタイラーで実験を行っていた！そして、ライラの森で救出したラゴウが現れ……。
突然起こった地震と火山の噴火の原因を突き止めるために、遺跡へ向かう主人公。ゴーゴー団の妨害をはねのけながら進んでいくと、遺跡の奥では、ゴーゴー団にキャプチャされたエンテイが！このまま放っておくと、火山は大爆発を起こしてフィオレ地方は大変なことになってしまう！
終盤<1>～最終対決 ゴーゴー団に挑め！
ついに、アジトへ乗りこんだ主人公。ゴーゴー団の野望を打ち砕け！
シンバラ教授が奪われたスーパー・スタイラーを取りもどすべく、シクラ山脈の頂上にあるというゴーゴー団のアジトへ向かう主人公。いろいろなしかけや、ゴーゴー団幹部4兄弟との対決など、次々と敵が挑んでくる史上最強のミッションをはたしてクリアできるのか！？
終盤<2>～伝説のポケモン登場！
伝説のポケモンは、かなりの強者。キャプチャ・テクニックを駆使しよう！
思いのままに炎を呼び出し自在にあやつり、強力な火炎を放つ伝説のポケモン「エンテイ」に続いて、「スイクン」「ライコウ」も登場！分身してすばやく動くので、本当の姿を見たものはいないと言われるスイクンと、電気を身にまとい、すばやく動きながら雷を落とすというライコウ。どのポケモンも強力な攻撃を繰り出すぞ！
