大都会にやってきたサトシたち。そこでピカチュウはやんちゃなピチュー（弟）＆おとなしいピチュー（兄）に出会うんだ。ビルの上でふざけている弟ピチューを気にするピカチュウ。あやまってピカチュウが落ちちゃった！バスの屋根、川の中、空へ吹き飛ばされてデルビルの背中の上へ。デルビルに追いかけられ、ピカチュウたちはタイヤの＜ひみつ基地＞に。あばれたから、基地はくずれちゃった。ポケモンたちを呼んで、力を合わせて基地を建て直す。あっ、もう帰らなきゃ。ピカチュウはピチュー兄弟に連れられて、サトシたちの待つビルへ向かったのだが…。ピカチュウはサトシとの約束の時間にまにあうのかな？